RMSD_RMSF_RG_HBONDS_SASA_ENERGY_PCA.py : RMSD_Protein_Grouped.png/.svg RMSD_Ligand_Grouped.png/.svg RMSF_Grouped.png/.svg Rg_Grouped.png/.svg SASA_Grouped.png/.svg HBonds_Grouped.png/.svg Energy_Grouped.png/.svg PCA_Grouped.png/.svg FEL.py : FEL_CNP007.png/.svg FEL_CNP018.png/.svg FEL_CNP019.png/.svg PCATIME_BOXPLOTS_RMSDVSENERGY.py : PCA_TimeColored_CNP007.png/.svg PCA_TimeColored_CNP018.png/.svg PCA_TimeColored_CNP019.png/.svg PCA_individual_CNP00X.png RMSD_Protein_Boxplot.png/.svg RMSD_Ligand_Boxplot.png/.svg RMSD_vs_Energy_Scatter.png/.svg PCA_Eigenvalues.png/.svg PCA_Cumulative_Variance.png/.svg