Additional file 1 An alignment of KU855474.1 Artocarpus altilis, a related species, with Treculia africana var africana Alignment: bioedit alignment africana.txt ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 5 15 25 35 45 55 Ab1 ---------- ---------- ---------- -----CTTCC GTAGGTGAAC CTG------- Ab2 ---------- ---------- ----TTTAAC AARG-TTTCC GTAGGTGAAC CTACAAGGTT Ab3 ---------- ---------- ---------- -----MTTCC GTAGGTGAAC CTGY------ Ab4 ---------- ---------- ---------- ---C-TTYCC ---------- ---------- Ab6 ---------- ---------- -------CTT CCGTATTTSC TTCCGT---- ---------- Ab7 ---------- ---------- ---TWWTAAY AAGG-KTTYC GT-------- ---------- Ab8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab10 ---------- ---------- ----TTMTWC WAAR-WTTCC GTAGGTGAAC CTGCGGAAGG Ab11 TTAT------ ---------T MTTAAATTCA SCGGGTATCC CTACMTG--- ---------- Ab12 ---------- ---------- -----TMTWC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTGCGGAAGG Ab13 TTTT------ ---------K CTTAAATTTA KSGGGTATAC CCACCGG--- ---------- Ab14 ---------- ---------- ---------- -AGSTTTTTT GTTAATCAG- ---------- Ab16 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab17 ---------- ---------- ----TTTAAC AAGG-TTTCT GTAGGTGWTT TAACAAGG-- Ab18 ---------- ---------- TTTAACTAAC ATGS-TTTAG GTGGGTSASC GGRAGGAAGT Ab19 ---------- ---------- --TTTTMWAC WWGG-TYTCC GTAGGTTTTT MAACAAGGTT Ab20 ---------- ---------- ----CTCAAC AAGG-TTTYM GTAGGTGAMC AAG------- Ab21 ---------- ---------- --TWACAAAC AAGG-TTTCS GT-------- ---------- B22 ---------- ---------- ---------- -------TTT AATAGG---- ---------- B24 ---------- ---------- -------AWY AAGG-TTWCC GTAGGTGAAC CTAGG----- B25 ---------- ---------- ----TWAAAM AAGG-TTTCY GTAGGTG--- ---AACGGTT B26 ---------- ---------- ---TATAAAC AAGG-TTTCS GTAGGTG--- -----AAGTT B27 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- B28 ---------- ---------- ---TTTTWWC AAGG-TTTCC GTAGGTGA-- ----ACAAGG B29 ---------- ---------- ---------- -------CCC ATCCGTG--- -TY------- B30 ---------- ---------- --TWTATAAA ARTTTTTSAT AAAAGT---- ---------- B32 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- CTGCGGAAGG B33 ---------- ---------- --------AC AAGG-TTTCC GTAGGT---- ----ACAAGG B34 ---------- ---------- ---------C AAGGYTTCYG CAAGGT---- ---------- B35 ---------- ---------- ---------- ------TATT AAAACS---- ---------- B36 ---------- ---------- ------TAAC AAGT-TTTAA GTTAACAAG- ---------- B37 ---------- ---------- ----TTTAWY TAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTGCGGATTC B38 ---------- ---------- -----TTATC AARRTTTTTT TTTATCAAGG ---------- B39 ---------- ---------- ------TAAC AAGG-TTTCC GTA------- ---------- B41 ---------- ---------- -----CTAAC AAGG-TT--- ----CT---- ---------- B42 ---------- ---------- -----TTAAC AAGG-TTTCC GTAG------ --------GG B43 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- B44 ---------- ---------- ------TAAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAT- -A--ACAAGG D48 ---------- ---------- -------AAC AAGG-TTTCC GTAGGT---- --------GG D49 ---------- ---------- --GGGGTAAC AAGG-TTTCC TAACAAG--G ---------- D50 ---------- ---------- ------TAAC WAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTG------- D51 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- D52 ---------- ---------- ------TAAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTGG------ D53 ---------- ---------- --------AC AAGG-TTTCS GTAGGTGAAC CTGMGGATCG D54 ---------- ---------- --------AC AAGG-TTTCS GTAGGTGAAC CTGMGGATCG D55 TTATGYTTAA ATTSARCGGG CTTAAATTCA GCGGGTATCC CTCCCTG--- ---------- D56 ---------- ---------- -G---CTAAC AASG-KTTTT ATACAAGCAA GGGTTTTA-- E57 ---------- ---------- --------AY AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTG------- E58 ---------- ---------- ------TAWY AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTG------- F59 ---------- ---------- -------AAC AAGG-TTTCC GTAGGTGWAC CTGGG----- F60 ---------- ------TTWM TTACWTTWYC TTGG-TTKSC KTAGCGGASG SAKSGATAGR F61 ---------- ---------- ------TAWC AAGGTTTTCC GTAGGTGAAC CTG----C-- F62 ---------- ---------- -------AAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAGT CTGCG----- F63 ---------- ---------- ------TAAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTGCG----- G64 ---------- ---------- ------TAAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTG------- G65 ---------- ---------- -------AAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTGCGGAAG- G66 ---------- ---------- ------TAWC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTGCGGAAGG G67 ---------- --------AW GGGTYTTAAC AAGG-TTTTS GKAGGWGAAC CTKSGGAA-- G68 ---------- ---------- -------AAC AAGGTTTTCC GTAGGTGAAC CTGCG----- G69 ---------- ---------- -----TCWAC AAGGTTTTCC GTAGGTCA-- ----ACAAGG G70 ---------- ---------- -------AAC AAGG-TTTCY GTAGGTGARC CTAACA---- J74 ---------- --TATMAARR AKTTTRTAAC AGGG-TTTCY GTAGGTGAAC TAA----C-- J76 ---------- ---------- -------AAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTGCGG---- J77 ---------- ---------- -------AAC AAGG-TTTCC GTA-----AC AAGG------ J78 ---------- ---------- -----TTAAC AAGG-TTTCS GTAGGTGAMC YTKG------ J79 ---------- ---------- -----TTTAM AARG-TTTYY GTAGGKGA-- ---ACCCGTT J80 ---------- ---------- ---TTTTWAC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CTG----C-- J81 ---------- ---------- -TAACWAARC AAGG-TTTGG GTAGCTGAMC STAGGGAAGG J82 ---------- ---------- -----TTAAC AAGG-TTTCC GTATTA---- ----ACAAGG J83 ---------- ---------- -------AWC AAGG-TTTCC GTAGGTGAAC CA--ACAAGG J84 ---------- ---------- --------AC AAGG-TTTCC GTAGGTGA-- ----ACAAGG J85 ---------- ---------- ------TAWC AAGG-TTTCS RYAGGTGAAC CTGCGSAAGG J86 ---------- ---------- ------TWAC AAGG-TTTCC GTAGGTTA-- ----ACAAGG KU855474.1 ---------- ---------- ----TGCGGA AGGACATTTC GAAATCTG-- ---------- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 65 75 85 95 105 115 Ab1 ---------- ---------- ---------- -------CTT CCGTAG---G TGAACCTG-- Ab2 T--------- ---------- ---------- ---------- CCGTAG---G TGAACCTG-- Ab3 ---------- ---------- ---------- -------ATT CCGTAG---G TGAACCTG-- Ab4 ---------- ---------- ---------- --------TT CCGTAA---G GGAACCTG-- Ab6 ---------- ---------- ---------- -------ATT TGGTAG---- -GTGGAAGG- Ab7 ---------- ---------- ------TATT AATAAGGTTT GCGTAG---G GGAACCTG-- Ab8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab10 AT-------- ---------- ---------- -----CATTA CCGAGT---G TTTGGACTG- Ab11 ---------- ---------- ---------- --------AT CCGAGG---- TCAMCCTGG- Ab12 AT-------- ---------- ---------- -----CATTA CCGAGT---G TTTGGATG-- Ab13 ---------- ---------- ---------- --------GT TCCCGG---- TCMWCCCGGG Ab14 ---------- ---------- ---------- ---------T ATGTTTSCGG TGGCCCGG-- Ab16 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab17 ---------- ---------- ---------- -------TTT CTGTAG---G TGTTCCTG-- Ab18 TT-------- ---------- ------AACT AACATGGTTT AGGTGG---G TGASCGGG-- Ab19 ---------- ---------- ---------- ---------T CCGTAG---G TGAACCTG-- Ab20 ---------- ---------- ---------- ------GTTT YMGTAG---G TGAMCCTG-- Ab21 ---------- ---------- ------TACA AACAAGGTTT CGGTAG---G TGAACTTG-- B22 ---------- ---------- ---------- --------TT TTCTAG---A GGAACCCC-- B24 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- B25 ---------- ---------- ---------- ---------T CTGTAG---G TGAACCTG-- B26 ---------- ---------- ---------- ---------T CGGTAG---G TGAACCTG-- B27 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- B28 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- B29 ---------- ---------- ---------- -------TAT CCATA----- ---MCCTS-- B30 ---------- ---------- ---------- --------TT TTGTAG---G GGAACCCG-- B32 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A TCATTACTG- B33 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- B34 ---------- ---------- ---------- --------TT CTGTAG---T AGAACGGG-- B35 ---------- ---------- ---------- --------TT CKGAAGTATT AAAACCTT-- B36 ---------- ---------- ---------- ------TTTT AAGTAG---G TGAACCTG-- B37 ---------- ---------- ---------- ---------- -CGTAG---G TGAACCTG-- B38 ---------- ---------- ---------- -------TTT TTTTAG---G TGAACCTG-- B39 ---------- ---------- ---------- ----AGGTTT CCGTAG---G TGAACCTG-- B41 AACA------ ---------- ---------- ----AGGTTT CCGTAG---G TTAACCTG-- B42 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- B43 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- B44 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- D48 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- D49 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- D50 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- D51 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- D52 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- D53 ---------- ---------- ---------- ---------- --GTAG---G TGAACCTG-- D54 ---------- ---------- ---------- ---------- --GTAG---G TGAACCTG-- D55 ---------- ---------- ---------- --------AT CCGAGG---- YCAACCTGG- D56 ---------- ---------- ---------- TACAAGGTCT CGGTAG---G GGAACCTG-- E57 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- E58 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- F59 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTGC- F60 TAAGGGATAG A--------- ----TAAGTA AACAAGGTTT CCGTAG---G TGAACCTG-- F61 ---------- ---------- ---------- GG-------T CCGTAG---G TGAACCTG-- F62 ---------- ---------- ---------- --------GA AGGAAG---G TGAGTCTG-- F63 ---------- ---------- ---------- -------GAA GGATCA---T T---ACCG-- G64 ---------- ---------- ---------- -------CTT CCGTAG---G TGAACCTG-- G65 ---------- ---------- ---------- ---------- CCGTAG---G TGAACCTG-- G66 ---------- ---------- ---------- ---------- --ATCG---G TGAACCTG-- G67 ---------- ---------- ---------- GGATCATTAT CG--AG---G GGAACCTC-- G68 ---------- ---------- ---------- -------GAA GGATAG---G TGAACCTG-- G69 T--------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- G70 ---------- ---------- ---------- ----AGGTTT CYGTAG---G TGARCCTG-- J74 ---------- ---------- ---------- AGGGT---TT CCGTAG---G TGAACCTG-- J76 ---------- ---------- ---------- ----AG-TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- J77 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- J78 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAGCTTG-- J79 ---------- ---------- ---------- ---------T CCGTAG---G TGAACCTG-- J80 ---------- ---------- ---------- GGCAAGGTTT CCGTAG---G TGAACCTG-- J81 ATCAGAGTSG AGTGTTKGGA CKCCCCGGGG YGGAAGGTTT GGGTAG---C TGAACGTA-- J82 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- J83 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- J84 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- J85 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------A TCATTA-TG- J86 ---------- ---------- ---------- -------TTT CCGTAG---G TGAACCTG-- KU855474.1 ---------- ---------- ---------- ---------C CCACAG---A AAGACCCG-- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 125 135 145 155 165 175 Ab1 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GC-TGYG-WC Ab2 -------CGA AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGCG-TC Ab3 -------CGG AAGAATCATT GCAGAGAG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-WC Ab4 -------CGG AAAGAACAAT ACCGAATG-- SGGGC--CCT ----YT---- ----GGG-TM Ab6 -------ATC AAGGATCATT GGGCAGTG-T TTGGATCCAC ----CTTCTS ATSSGTG-TM Ab7 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTTGAYACYS ----CTTCKR GG-GGKG-TC Ab8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- GG-GGTG-TC Ab9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C Ab10 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC Ab11 ---------- -TTAAAGTAA AAAGGTTGGG GTTGGG---- ---------- ---------- Ab12 --------GG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC Ab13 TAAAAAAASG TTTTAAAAAA ACAGGTTTSG GTCAAGACCC YCAGCAGCGT TTTAAAAAAA Ab14 --------AT CATGAYTGAG TSCGGGCCCT TTGGGTCCCC ----CTTCCC GGGSGGG-TC Ab16 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------G-TC Ab17 -------CGG AAGGATCATG AAGGAGTT-T TTGAAAGCCC ----TTTGTC GG-GGTG-WY Ab18 -------AGG AAGAATCATG ACCGATTG-T ATGRACCTTC ----TTGGGR GG-GGSG-TC Ab19 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC Ab20 -------CGG AAGRATCATT ACCGAGTG-T TTGGACACCC ----CTTCTC RR-GGTG-TC Ab21 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGACCCYC ----CTTGTC GG-GGTG-TC B22 -------TGG AAAGGTAATA TTCSAGWG-T TTTGAGATSC --CCYTTCTS GGG--GTGYS B24 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTGTT TGGGCG-CCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC B25 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATRCCC ----CTTCTC GR-GGTG-TC B26 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC B27 ---------- ---------- ---------- ---GATGCCC ----GCTCTC GG-GGTG-TC B28 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTGGT TTGGATGCCC ----CTTCKC TGRGGTG-TC B29 -------Y-- ---------- ----YATT-- CGG------- ----CS---- ----GG---- B30 -------CGG AAAGATCATT TCCGAGAG-T KTG--GRTRC --CCCYTYTC GGG--GKGTS B32 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCGC GG-GGTG-TC B33 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC B34 -------CGG AGGAGGCATT CCTGAGGG-A TTGTCTTCYS --CTTSTCAC SG---GTGWT B35 -------CGG AAGTATCAAT CCCGAGGG-A GTGGATGCCM TGCCGTTCWM GGTGTGAATC B36 -------GGG AAGGATCATA ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTMTC GG-GGTSGTC B37 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC B38 -------CGG AAGGAACATT CCCGAGAG-T TKGGAYGCYS ----CTTCTA ACSGGKGRTG B39 -------CGG AAGGATCATT TCCGAGTG-- CGGGC--MCT ----YW---- ----KGR-YC B41 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGRATGCCC ----CTTSTS GG-GGKG-TC B42 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TKGGATGCCC ----CCTCGC GG-GGTG-TC B43 ---------- ---------- ---------- -------CTT ----CT---- ----GGG-TC B44 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGACACCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC D48 -------CGG AAGGATCATT MCCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC D49 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTT-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC D50 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC D51 ---------- ---------- ---------- --------CT ----CT---- ----GGG-TC D52 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC D53 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC D54 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC D55 ---------- -TTAAAAAAA AAAGGTTGGG GTTGGG---- ---------- ---------- D56 -------CGG AAGGATCTTT ACCGACCG-- CGGCC--CCT ----YK---- ----GGG-TC E57 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC E58 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC F59 -------GGA AAACAAGGTT TCCGTAGG-- ---TGWACCT ---------- ---GGGTTTC F60 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----GT---- ----GGG-TC F61 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC F62 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGCCCTWT ---------- ----GGG-TC F63 -------AGT GCGGGCCST- -CTGGGTC-- CAACCT-CCC ----AT---- ----GGG-TC G64 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC G65 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGACACCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC G66 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC G67 -------CGG AAGGATCATT ATCGAGTG-- CGGGG--CCT ----TT---- ----GGG-TC G68 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC G69 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC G70 -------CGG AAGGATCATT ACYGAGTG-- CGGGY--CCG ----AT---- ----GGG-TC J74 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----GT---- ----GGG-TC J76 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC J77 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC J78 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGAATACCC ----CTTCTM GG-GGAG-TC J79 -------TGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATCCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC J80 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-- CGGGC--CCT ----CT---- ----GGG-TC J81 -------GGG AAGGATCAGA GTGGAGTG-T TTGGACTCCC ----CKKSKC GG-SGTG-TC J82 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC J83 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC J84 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC J85 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCTC GG-GGTG-TC J86 -------CGG AAGGATCATT ACCGAGTG-T TTGGATGCCC ----CTTCGC GG-GGTG-TC KU855474.1 -------CGA ACAGGTTACA ACGTTTGGGG GGCGAGGGGT G---CAACGC GC-CTTG-AA ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 185 195 205 215 225 235 Ab1 MSTYCTCCCA T-------CS GMR----TST ATTTGTACCM TGKKK----- CTTSGK---- Ab2 CGTCCTCCCA Y-------CC GTG----TYT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCRG---- Ab3 CGTSCKMMYA Y-------CG GTG----YCT ATTTGTACCC TGKTG----- STTMSG---- Ab4 CAACCTYCCA W-------CC GTG----WYT YTTGT-ACCC TGTTG----- CTTCGG---- Ab6 TATCYTATCA CC------TG GTG--KMWMW KKGGGCTTCC CGTTG----- -GTTGS---- Ab7 CGTCCTMCCM T-------MC GTY----TKT ATTWGTWCCC TGSTG----- STTWGK---- Ab8 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TSTTGS---- CTKCGG---- Ab9 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- Ab10 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- Ab11 CAGGCCGCCG G--------C CGG----ACC TACAGGAGCG GGTGA----- CAAAAAAAGT Ab12 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- Ab13 CAGGTTTTGG T--------C AAG----ACC CTCMGCAGCG GGTGR----- SRWRAMG-TG Ab14 TCTCTACAAC GTGTTTGTTT GTGRACMTSC KKGGSTATCC TWCTCYGWKG YTTCSGGSCY Ab16 CGTCCTCCCA T-------CC GAG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- Ab17 CGTCCTCCYA T-------YS GWS----YCT RTTTGTKCCC TKTTG----- STTCSG---- Ab18 CSTCCTCCCR T-------SY GYG----TYT RTTYGCMCYY TGTTG----- SKTSGG---- Ab19 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- Ab20 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTMGG---- Ab21 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TTT ATTYGTASMM YRTWS----- CTWMRR---- B22 YSTCCYCCCA T-------SY GTG----TMT WTTTGTMCCS TGTTG----- YTTYGG---- B24 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- B25 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- YTTCGG---- B26 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- B27 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- B28 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- B29 ---------- ---------- -TG----TCT ATYCATACCC TGTTG----- MTTCGG---- B30 YSTCCYCCCM Y-------CC GTG----TST ATTTGTRCCC YGTKK----- YTTYGG---- B32 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- B33 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- B34 CGTCCTCCYA T-------CC KMSC---TYT RTTKKTTCCC KGKTS----- CTTYSG---- B35 CGKCSTCCCW T-------CC STG----TCG WTTTGTYCCC TSKTK----- STTYYK---- B36 CSYCSTCCCA T-------CC GWG----YCT ATTTGTACCY TGTTG----- MTTCGG---- B37 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT ATTTGTACCC TGTTG----- CTTCGG---- B38 SGTCCTCCYM Y-------CC GWG----TYT WTTKKTTCCC TGKTK----- YTTYSG---- B39 CMACCTAMCC WT------CC KTG----TMT CTTGT-AYYY TGCSG----- SWWCGG---- B41 CGYCCTCCCA T-------CC GKG----TYT ATTTGTACCY TGTTG----- STTSGG---- B42 CGTCCTCCCA T-------CC GTG----TCT 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---------- ---------- Ab4 CGGG----CC CKCCTT---- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 CCST----CT CGGCGGAKWM G--------- ---------- ---------- ---------- Ab7 GGGG----CC SCCCYTYTGK T--------- ---------- ---------- ---------- Ab8 SGGGWKTTCC YKCCCYYCGK G--------- ---------- ---------- ---------- Ab9 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- Ab10 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- Ab11 TGCTT---CC CATACG-CTC GAGG------ ---------- ---------- ---------- Ab12 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- Ab13 AGCTT---CC YATACAKMTC GSMR------ ---------- ---------- ---------- Ab14 CGGGK---CC GGCCGSTTKC CCWCMCCYG- ---------- ---------- ---------- Ab16 CGGG----SC CGMCCTTCSY K--------- ---------- ---------- ---------- Ab17 KGGG----SC CCCCCTTSGK G--------- ---------- ---------- ---------- Ab18 CGGS----CC CWYCYTKSRM G--------- ---------- ---------- ---------- Ab19 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- Ab20 CGGG----CC CGCCCTTCST G--------- ---------- ---------- ---------- Ab21 CGKK----SS YGCCSTKSGW R--------- ---------- ---------- ---------- B22 SGGG----CC CSCCCTTYKK G--------- ---------- ---------- ---------- B24 CGGG----CC CGCCCTCTG- ---------- ---------- ---------- ---------- B25 CGGG----CC CSCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- B26 CGGG----SC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- B27 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- B28 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- B29 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC B30 SGGG----CC CSCCCTTYGT G--------- ---------- ---------- ---------- B32 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- B33 CGGG----CC CGCCCTTCGT GGCCGCCGTG TCTATTTGTA CCCTGTTGCT TCGGCGGGCC B34 YGGG----GC CGCCCTTSSK K--------- ---------- ---------- ---------- B35 TGGG----CC CGCCCTTCGK G--------- ---------- ---------- ---------- B36 SGGS----CC CGCCYTTCSY G--------- ---------- ---------- ---------- B37 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- B38 KGGG----SC CSCCCTTSKK G--------- ---------- ---------- ---------- B39 CGGS----CC CRCMWTC--- ---------- ---------- ---------- ---------- B41 CGGG----CC CGCCCTTCST G--------- ---------- ---------- ---------- B42 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- B43 GGGG----CT CCCCGGGTGC CCCT------ ---------- ---------- --------YC B44 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- D48 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- D49 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC D50 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC D51 CGGG----GC CGCCTTT--- ---------- ---------- ---------- ---------- D52 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC D53 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- D54 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- D55 TGCTT---CC CATACG-CTC GAGG------ ---------- ---------- ---------- D56 TGGG----GC YYCCTTT--- ---------- ---------- ---------- ---------- E57 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC E58 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC F59 SGGG----CC CSCCGGSTGC CCCYCCTG-- ---------- ---------- ---------- F60 SG-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- F61 CGGG----CC CGCCTT---- ---------- ---------- ---------- ---------- F62 CGGG----CC CGCCGGCTGC C--------- ---------- ---------- ---------- F63 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC G64 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC G65 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- G66 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- G67 SGGG----SC CYSCTTT--- ---------- ---------- ---------- ---------- G68 SGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC G69 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- G70 SGGG----CY YSCCGGSTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC J74 YGGG----SC CGCCTT---- ---------- ---------- ---------- ---------- J76 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC J77 CGGG----CC CGCCGGCTGC CCCT------ ---------- ---------- --------CC J78 SGGS----MC CWCCYTTMGT G--------- ---------- ---------- ---------- J79 CGGG----CC CGCCCTTYGT G--------- ---------- ---------- ---------- J80 CGGG----CC CGCCTTC--- ---------- ---------- ---------- ---------- J81 CGGG----CC CKCCYTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- J82 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- J83 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- J84 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- J85 CGGG----CC CGCCCTTYGT G--------- ---------- ---------- ---------- J86 CGGG----CC CGCCCTTCGT G--------- ---------- ---------- ---------- KU855474.1 CCAAMAACCA ACCCCGGCGC G--------- ---------- ---------- ---------- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 305 315 325 335 345 355 Ab1 ---------- -CKCC--RCS GGGGG---RK WCCCT---GC CCCCGGGMC- --CG--TGYC Ab2 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GST TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC Ab3 ---------- -ATCS--CCG GGGGG--GTT TCCCT---RC CCMCGGGCC- --CS--TSCC Ab4 --------TT GGCCG--CCG GGGG---G-C TTCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--CGCC Ab6 ---------- TGSCC--CSG RATKK--GGT KAAMCC--KS CCCKSKGSC- --CG---SYC Ab7 ---------- -AACG--CCR KGRRR--RKT YCCWG---CC CCCSGGGCAC T----GCACC Ab8 ---------- -SCCGTCCCG GGGG---GCT TCCYT---SC CCCCGGGCC- --CG--TSCC Ab9 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC Ab10 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC Ab11 ---------- -ACCGGACAC KGTG---CCG CCGYTG--CC TTTCGGSCCC G-----TCCC Ab12 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC Ab13 ---------- -ACCGSWCGS GGTC---CGG CCGCTGTGYY TTTCGGGCCC S-----YYYC Ab14 ---------G GGAYSSMCGG RGGRAASGCY TTCATCYGMC CMMSGGGCCR ------RTAC Ab16 ---------- -GSCS--SCG GGCSS--GYK TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC Ab17 ---------- -SYCS--YCG GGGG---GCT TCCSK---GC CCCYGGGMCM R-----YGCC Ab18 ---------- -GTCS--GSG GGGGG--TMT TCCCY---SC CSCSGRKMCC -----GWGCC Ab19 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC Ab20 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGSC- --CG--WGCC Ab21 ---------- -CCCR--CSG GGGGG---CT TCCCT---GC MSCSGGGCCC -----GYSCC B22 ---------- -GCCR--CSG GGGG---GYT TCCCT---GC CCCCGGGSC- --CS--TGTC B24 ---------T GGCCG--CCG GGGG---GCT TCCCTT--GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B25 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B26 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B27 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCMT---GA MCMCCGKCTG MMSG--TKSC B28 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TTCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B29 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B30 ---------- -KYCG--CSG GGGG---GST TYYCY---SC CCCCGGGMM- --SG--TG-C B32 ---------- -GCCR--CCG GGGG---GCT TTCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B33 CGCCCTTCGT GGCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B34 ---------- -TTYS--YSG GGGG---GGT TCCYT---SC CCCCGGSRS- --RS--TS-C B35 ---------- -GSSG--CCG GSSG---GCT TYCST---GY CCCCGGGSC- --SG--WS-C B36 ---------- -GYCG--CCG GGGG---GKT TSSSK---GY CCCYGGGCS- --SS--TGYC B37 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC B38 ---------- -GYCG--CCG GGGG---GGT TCCCT---SC CCCCGGGMC- --CS--TSCC B39 --------AT GGCCG--CCG GGGG---G-C TT-CT---GC CCCCGGGCC- --CG--CGCC B41 ---------- -SCCG--CCG GGGGG---CT TCCCT---GC CSSCGGGMC- --CG--WGCC B42 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--CGCC B43 TGGKKMTGCC SGGCG--CCG GGGR---GTT WMYYT---SK SCCCGGGSC- --CGMGTGSM B44 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC D48 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC D49 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC D50 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC D51 --------T- GGCCC--CCG GGGG---G-C TTCG----GC CCTACTGAC- --CK--CRMM D52 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC D53 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GYT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC D54 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GYT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC D55 ---------- -ACCGGACAC GGYG---CCG CCGCTG--CC TTTCGGGCCC G-----TCCC D56 --------TT GGCCG--CCS KGGG---G-S TTCCT---GS CCCCGGKCC- --CY--CGCC E57 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC E58 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC F59 --GGGATGCC GGCCG--CCG GGSS---GCT AACCY---GS CCCCSGGCC- --CG--TGCC F60 ---------- ---------- ---------- ----T---GS CCACG----- -------GCC F61 --------TT GGCCG--CCG GGGG---G-C TTCCC---GC CCCCGGGCC- --CG--CGCC F62 ---------- --CCT--CCT GGGG----AT GCCGTA--AC AAGGGGGGCG TAGG--CTCC F63 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC G64 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC G65 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC G66 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC G67 --------T- GGCCG--CCG GGGG---G-G TTCCT---GC CCCCGGGSC- --CS--CGCC G68 TGGGGATKCC GGCCG--CCG GGGG---GST AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC G69 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC G70 TGGGGATGCC GGGCSG-CCK GGGG---KYT AACCT---GC CCCCGGGCC- --C--GTGCC J74 --------TT GGCCG--CCG GGGG---G-S TTCCT---GC CCCCGGGYC- --CG--CGCC J76 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J77 TGGGGATGCC GGCCG--CCG GGGG---GCT AACCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J78 ---------- -GMYG--CCG GGGG---GYT TCCYT---RC CCCCGGGMC- --CR--WGCC J79 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GST TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J80 --------AT GGCCG--CCG GGGG---G-C TT-CT---GC CCCCGGGYC- --CG--CGCC J81 ---------- -GCSG--SSG GGGGG--CCT TCCCT---SC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J82 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J83 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J84 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J85 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TCCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC J86 ---------- -GCCG--CCG GGGG---GCT TTCCT---GC CCCCGGGCC- --CG--TGCC KU855474.1 ---------- GAATGTTTCA AGGAA--ACA TAAAG----- AAACGAGCTT --CTG-CTGC ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 365 375 385 395 405 415 Ab1 CR-YMRRAKA C----MTCAY YYATG----- ---------- ---------- ---------- Ab2 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab3 CG-MCSGMGA C----CTCAA CCAWG----- ---------- ---------- ---------- Ab4 CS-CCGGARA C----TCCAA CACCG----- ---------- ---------- ---------- Ab6 GASACSGGRA CA---CYCRA CMMTG----- ---------- ---------- ---------- Ab7 CR-YCKGAAR S----CTYAA MCATT----- ---------- ---------- ---------- Ab8 CG-CCGGAGA C----CTCAM CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab9 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab10 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab11 CTT----GGG GG----GGGA CGGGG----- ---------- ---------- ---------- Ab12 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab13 SKTCCYGGGM SG----GGKR GGGGG----- ---------- ---------- ---------- Ab14 CWMCKRRRAS K----YTCAA CCCYS----- ---------- ---------- ---------- Ab16 CG-MCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab17 CS-YCGGASM C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab18 CG-MSGGAKA C----MTCAT YWMYG----- ---------- ---------- ---------- Ab19 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab20 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- Ab21 CG-CCRGAGR M----CTCAA CCMTG----- ---------- ---------- ---------- B22 CCSCCGGAGA CCY--CACAC CCATGA---- ---------- ---------- ---------- B24 CG-CCGGAGA C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- B25 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B26 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B27 MG-YCKGAGA C----CTCMA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B28 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B29 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- B30 SCSCSGGRGA CC----TCAM CCAYRA---- ---------- ---------- ---------- B32 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B33 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B34 CCSCCGGAGG MC----WSAM CCAYGS---- ---------- ---------- ---------- B35 CCSCCGGARR MC----TCRY CYRYG----- ---------- ---------- ---------- B36 CG-SCGGAGA C----CYCAA CCWYG----- ---------- ---------- ---------- B37 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B38 CS-CSGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B39 CG-CCKRAGA C----TCCAA CMYCK----- ---------- ---------- ---------- B41 CG-CCGGAGM C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- B42 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATTGAACA CTGTCTGAAG GTTGCAGTCT GAGTACCGAT B43 SM-CGGGGGA C----CCCSA CWCTR----- ---------- ---------- ---------- B44 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- D48 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- D49 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- D50 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- D51 CR-CCGRAAA CAKTTYMAAG CACCS----- ---------- ---------- ---------- D52 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- D53 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- D54 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- D55 CTTCCTGGGA GG----GGGA CGGGG----- ---------- ---------- ---------- D56 CC-CCGGASA C----YCCAA CMCCS----- ---------- ---------- ---------- E57 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- E58 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- F59 CG-CCGGGGA C----ACCRA CACTG----- ---------- ---------- ---------- F60 CG-CCGAAGA C-----TAAC ATTTG----- ---------- ---------- ---------- F61 CG-CCGGAGA C----TCCAA CACG------ ---------- ---------- ---------- F62 CCCCAGAAGG -----ATCAT TCCGG----- ---------- ---------- ---------- F63 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- G64 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- G65 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- G66 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- G67 CS-CCGGAGA C----TCCAA CMCCG----- ---------- ---------- ---------- G68 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACYG----- ---------- ---------- ---------- G69 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- G70 CG-CCGKGGA C----ACCRA CACTG----- ---------- ---------- ---------- J74 CG-CCGGAGA C----TCCMA CACCG----- ---------- ---------- ---------- J76 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- J77 CG-CCGGGGA C----ACCAA CACTG----- ---------- ---------- ---------- J78 CG-CCGGAGA C----MTCAW CCATG----- ---------- ---------- ---------- J79 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- J80 CK-CCGGAGA C----TCCAA CATTG----- ---------- ---------- ---------- J81 SGACCGGAGA C----CTCAR CCATG----- ---------- ---------- ---------- J82 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- J83 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- J84 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- J85 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- J86 CG-CCGGAGA C----CTCAA CCATG----- ---------- ---------- ---------- KU855474.1 GGCCCCAGGT C-----TGGT GCTTG----- ---------- ---------- ---------- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 425 435 445 455 465 475 Ab1 ---------- ------AACA STG----TYT MWWGG-TTG- CWGKCATGAR TAYAG----- Ab2 ---------- ------AACA CTG----TYT GAAGG-TTG- CAGTYTG-AG TACCG----- Ab3 ---------- ------AACA CTG----TCW GAAGG-TTS- CAG-TRTRAK TACMG----- Ab4 ---------- ------AACA CTG----TCT RAAGG-TTG- CAGWMTG-AG TTTT------ Ab6 ---------- ------RACA CTG----TST GAARG-TTK- SAGTMTGAAK TWTCAT---- Ab7 ---------- ------TACR ATA----TTT GAAG--ATWC SAARGGA-AR TGCCATAAT- Ab8 ---------- ------AACR CTG----TCT GAAKG-TTS- CAGTCTG-AG TMCCG----- Ab9 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- Ab10 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- Ab11 ---------- -------GCS CAAC---ACA CAAGCCGTSS CTKAGGGCAG CAATG----- Ab12 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- Ab13 ---------- -------GCS CAMC---CCS CAASCCGSSY YSSARGGMAC MAAKG----- Ab14 ---------- ------AACA CYG----GGT WAAGAAGKTT CAATGMKMMA YTYAR----- Ab16 ---------- ------AACA CTG----TST GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACYG----- Ab17 ---------- ------RACR MTK----TYW RAAGG-TTK- CARTSTG-AG WACCK----- Ab18 ---------- ------AMCW CTG----TMT GAAG--SWTG CRGYSTR-AR TACYRAAA-- Ab19 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- Ab20 ---------- ------AACA CTG----WCT GAAGG-TTG- CAKYMTG-AR TACCG----- Ab21 ---------- ------AACW CTGGTWTKAT TAKG--TYK- CAGTYTG-AG TAMMRAAM-- B22 ---------- -------ACA CTG----TST GAAAGGTTCR CAGTYWG-AG TMCMK----- B24 ---------- --------CT CA-------- ---------- ---------- ---------- B25 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- B26 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- B27 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- B28 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- B29 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ B30 ---------- -------ACM CYR----TMT GAAGG--TWG YAGTSTS-AR TWCCG----- B32 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- B33 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- B34 ---------- -------MCR CYG---TTCT GAAGG--TKG CAGTAKK-AW WASYK----- B35 ---------- -------ATK CWGA--CTCT GAAWR--TAK YRRTSTG-AK YASSG----- B36 ---------- ------ARMA CYG----TST GAAGA-GTGK CARYYTG-AK TACCK----- B37 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTMTG-AG TACCG----- B38 ---------- ------AACA CTG----TST GAAGG-TTG- CAGTSTG-AG TWCMG----- B39 ---------- ------AACA CTG----TGT KAAGG-TTK- YAKTRTG-AG TTTTTACATT B41 ---------- ------AACA CTG----WCT GAAGG-TTG- CAGKSTGAG- TACCG----- B42 ACAGAAAATC GTTAAAACCA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- B43 ---------- ------SACA CTG----KRT GAAGG-YTG- SAGTRTG-AR TTTT------ B44 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- D48 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- D49 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ D50 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ D51 ---------- ------AAAA CWG----KYT AAWGG-KKK- CRGTAAMRAG TTTT------ D52 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ D53 ---------- ------AACM CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TRCCG----- D54 ---------- ------AACM CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TRCCG----- D55 ---------- -------GCC CAAC---AMA CAAGCCGTGC TTGAGGGCAG CAATG----- D56 ---------- ------AACM CTG----TTY GAAGG-WYG- CWGTYTG-AG TKTT------ E57 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ E58 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ F59 ---------- ------AACA MTG----TYT GAAGG-TTG- CAGWCTG-AG TTTTC----- F60 ---------- ------AACM CTG----TST GAAGT-TTG- CAGYYTG-AW YTTT------ F61 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CCGTCTG-AG TTTT------ F62 ---------- -------GGG ATT----CAT CACCATTTCA CATATTGMGR TATCSTMG-- F63 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ G64 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ G65 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- G66 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- G67 ---------- ------AACA CTG----TYT GAAGG-KKG- CAGTYTG-AG TTTT------ G68 ---------- ------AACA CTG----TYT GAAGG-TTG- CAGTYTG-AG TTTT------ G69 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- G70 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AR TTTT------ J74 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ J76 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ J77 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TTTT------ J78 ---------- ------AACA MTG----TYT GAAGG-TTG- CAGTYTG-AG TRCCR----- J79 ---------- ------AACA CTG----TST GAAGG-TTG- CAGTYTG-AG TACCG----- J80 ---------- ------AACA CTG----TYT GAAGG-TTR- CAGTCTG-AG TTTT------ J81 ---------- ------AACA CKG----WSK GAAGG-TTG- CAGTYTGAGA TACYR----- J82 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- J83 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- J84 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- J85 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- J86 ---------- ------AACA CTG----TCT GAAGG-TTG- CAGTCTG-AG TACCG----- KU855474.1 ---------- -------CCG CAG-----CA GGAGG--TG- TCGTGTTTCG TCTAG----- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 485 495 505 515 525 535 Ab1 ---AACTAWA AAAWCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC Ab2 ---AYACAAA AAAYMG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC Ab3 ---ATACAAA AAATCG---- ---------- --------AA AAAACTTTTA ACGACGGATG Ab4 CAWAGAARAA AAAYCG---- ---------- --------CT AAAACTTTCA ACAACGGATC Ab6 --AATCGAAA AAAKTG---- ---------- ---------T AAAACTTTCG ATCTCTTATC Ab7 -CCCWTGAAA AAAWYR---- ---------- --------WT MAAACWTTMA AMRAAWGATY Ab8 ---AWATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGRATC Ab9 ---ATATAAA AAATCGTTAA AMCTTTCAMC AACAATCGTT AAAMCTTTCA ACAACGGATC Ab10 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA 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B27 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC B28 ---ATACAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC B29 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC B30 ---AWATAAA AAATYK---- ---------- --------KT AAAASTTTCA AMAAMRRATM B32 ---ATACAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC B33 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC B34 ---WTAWAAA AAATMR---- ---------- --------TT AAAWYTTTCA TCRMCGGATS B35 ---ATWTAWA WAATCR---- ---------- --------YT AAAAYTTTCA AYWASGGATM B36 ---ATAWAAA AAATMG---- ---------- --------TT AAAAYTTTCA ACAWSGGATM B37 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC B38 ---ATATAAA AAATMG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAMCGGATC B39 GAWAACTGWA AAAWAR---- ---------- --------TT AAAACTTKMA AYWACGGATC B41 ---AWATAAA AAATYG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAWYGGATC B42 ---ATACAGA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC B43 CAWAAWG-GA AAATTR---- ---------- --------TT AAAACTTTCR ACAASKKATC B44 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC D48 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC D49 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC D50 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC D51 CAWAAAASAA AAAYMK---- ---------- --------RT AAAACTTTCA AAAAMRGATM D52 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC D53 ---AWACAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC D54 ---AWACAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC D55 ---------A CGCTCG---- ---------- -------GAC AGGCAT-GCC CCCCGGAATA D56 CAWAWAARAA AAATCG---- ---------- --------WA WAAAYTTTCA AYAWSGGATY E57 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC E58 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC F59 ---ATAAAGG AACCRAC--- ---------- --------AC TGAACAMTGT YTGAAGGTTG F60 --TAGWTAAA CAATAA---- ---------- --------TT AAAACTTTCA WCAWCGGATC F61 CATATACGAA AAATCG---- ---------- --------TC AAAACTTTCA ACAACGGATC F62 --CATMCCKG AAKWTT---- ---------- --------CM KWAWSKAACW ATTTYYGATG F63 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC G64 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC G65 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC G66 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC G67 CATAAAAAAA AAATMG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA WCAACGGATY G68 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC G69 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC G70 CATAAAS-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACKKATC J74 CATAGAAGAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J76 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J77 CATAAAG-GA AAATTG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J78 ---ATAWAAA AAATMG---- ---------- --------TT AAAACTTTMA ACAASKGATY J79 ---ATACAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J80 YW-ATAAKAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J81 ---AWATAAA AAAWMG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA RSAWCGGATS J82 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J83 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J84 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC J85 ---ATATAAA AAATCG---- ---------- --------TT MAAACTTTCA ACAACGGATC J86 ---ATACAAA AAATCG---- ---------- --------TT AAAACTTTCA ACAACGGATC KU855474.1 -----GTCTA AAAACG---- ---------- ---------- ---ACTCTCG GCAACGGATA ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 545 555 565 575 585 595 Ab1 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT AAAG------ AACGCAG--- ---------- ---------- Ab2 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAR------ AACGCAKCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- Ab3 TC-TTGGTTC CGGAGTCGAT AAAC------ AACGCAA--- ---------- ---------- Ab4 TC-TTGGTTC CGGCATCAAT GAAA------ AACG------ ---------- ---------- Ab6 TC-TTGGATC CAGGATCAAT GAAG------ AACGCAGCAA T--------- ---------- Ab7 KW-TTGGWWM YGGCATWSWA TRAAG----- AAYSCWRAGA A-AAKSGATW ASTAATGTK- Ab8 TY-TTGGTTC CGSCATYGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATM SGTAATKTG- Ab9 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCASCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- Ab10 TY-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- Ab11 CCAGGGGGAG CAATGKGSGT TCAATG---- -GGACRGGCA TGCCCC-CCT TCTGCAATTC Ab12 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- Ab13 CCMRGGGGRR CAWSGGGGGT TCAAAR---- -RCTCRATGA WWCMCTGAWT TMTSCAATTC Ab14 CA-STGAAAG SAGATTTGTA MTGT------ --TCRATCGA T-CTTSCAGC MWTTMARYG- Ab16 TC-TTGGTTC CGGYATYGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA YGTAATGTG- Ab17 TC-TTGGTTY CGRMATSGAT GAAR------ ---------- ---------- ----TMGAG- Ab18 TS-TTGKWTC CRGYATM-YA TGAAK----- RAYSCARMAA AGATGCRATA MGKAAWRTG- Ab19 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- Ab20 TY-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACKCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- Ab21 TC-TTGGYTC YGGCATC-RA TGAAG----- AACGCAKYGA A-ATGCGATA MGYAAKGTG- B22 CTYTTGGTTY CGGAYATMGA WRAARAA--- --CRCAGMRA A-ATGCGATA YGTAAWRTGA B24 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B25 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B26 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B27 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B28 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCARCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B29 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B30 TCTATGKTTY CGG-CATCSA WRAARAAM-- -GCACACAGA A-AKGMGATA YGTAAWGTGA B32 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B33 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B34 TS-TTG-WTT CSGTWAYKSA ATAAGAACAG ARCGMAAYGA A-ATGCGAAA YGTAAAKTG- B35 TC-TTGRWTM MGGCATYKAT RAAK------ WWCGCAKWGA A-ATGMGAWA CGWAATGTG- B36 TC-TTGGTTC YGGCATCKAT GAAR------ AACKYAGARA A-ATGCGATA MRYAATGKG- B37 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B38 TC-TTGGTTC CRGCATCGAT GAAK------ AACGCAGMGA A-ATGCRWTA CGTAATGTG- B39 TY-TTGGTTC YGGMATCKWT SAAR------ AACGSAKCKM W-WKGCKATA RGWAATGTG- B41 TM-TTGGWTC CGKRATYGAT GAAR------ AACGCAWCGA A-AYRSGATA MKTAAWGTG- B42 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- B43 TS-TTGGTTC CGTRATMRAT GAAG------ AAMRMWGCGA A-ATGCRATR MGWAWTGTG- B44 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- D48 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- D49 TC-TTGGTTC CGGMATCRAT GAAG------ AACGCAGMGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- D50 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- D51 TC-TTKGTTC CGSCATRRAT WAAG------ AAMSCWGMRA W-ATSCMATR AAWAWTGKR- D52 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- D53 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGYWKCGA A-ATGCGATA CGTAAWGTG- D54 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGYWKCGA A-ATGCGATA CGTAAWGTG- D55 CCAGGGGGSG CAATGTGCGT TCAAAG---- -ACTCGATGA TTCACTGAAT TCTGCAATTC D56 TY-TTGGTTC SGGYATSGAK RAAG------ AACKCARYRA A-ATGSRATA SGWAATGTG- E57 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- E58 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- F59 CA---GWCTG AGTTTTCATA AAGG----AR AACRYRKSGA A-ATGCGAWA CGTAATGTG- F60 TY-TTGGTTC CGGMATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA ATTAATGTG- F61 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- F62 AGTTTGGTAR MMAWGYYAKK GATT------ MCCTCMSAAA ATATTGKTTG CAGTAGGRGA F63 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- G64 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- G65 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- G66 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- G67 TC-TTGGTTC CGGCATCGAK RAAA------ AACRCASMGA A-ATGCGATA CGWAATGKG- G68 TY-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- G69 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- G70 TC-TTGGTTC CGGCATCRAT GAAG------ AACSCAGCGA A-ATGCGATA CGWAWTGTG- J74 TC-TTGGTTC CGGYATCGAW GAAG------ AACRCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J76 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J77 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J78 TM-TTGGTTC CGGCATMRAT RAAK------ AACGCAGKAA A-ATKCSATA CGTAATGTG- J79 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAS------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J80 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J81 TY-TTGGTTC YGGMATCRAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAAWGTG- J82 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J83 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J84 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J85 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- J86 TC-TTGGTTC CGGCATCGAT GAAG------ AACGCAGCGA A-ATGCGATA CGTAATGTG- KU855474.1 TC-TCGGCTC TCGCATCGAT GAAG------ AACGTAGCGA A-ATGCGATA CTTGGTGTG- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 605 615 625 635 645 655 Ab1 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab2 -AATTG-CAG AATTCAGWGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- Ab3 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab4 -------CAA ACARA----- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab7 -AAWTR-RAR AATYCAGTSA ATTATYSASY A--------- -TTATTTAAM CCCRRGT--- Ab8 -AATTG-CAG AATTCAGKGA ATCATSGAK- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- Ab9 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- Ab10 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- Ab11 ACRTTA---- CATWTC-CAT TTCTCTGCG- ---------- -TTYTTCATC GATKCCG--- Ab12 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- Ab13 MCTTTR---- CWWWTCSCWT TTCSTTKCG- ---------- -TTTTTCWTC RAKKYCK--- Ab14 -------CAT CATKGAKCG- ATCTTMCAG- ---------- -WCTKKWAWC RCGCAT---- Ab16 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAWC GCACAT---- Ab17 ---------- ---------- ---------- ---------- -TMTTTGAAM SYCCAT---- Ab18 -AATWGMATG MATTCASTSA WTCATYGAG- ---------- -TYTTTRAAC ACTACAT--- Ab19 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- Ab20 -AATTG-CAK AATTCAGTGA ATCATCKAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- Ab21 -AATTG-CWG AATTMAGWGA ATCATCRAR- ---------- -TSTTTGAAC GC-ACRT--- B22 AWTKCA-GAA ATTACAGWRA ATYATMGAG- ---------- -TYTTWRAAC GCACWT---- B24 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B25 -AATTG-CAG AATTCAGWGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B26 -AATTG-CAR AATTCAGWGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B27 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TYTTTGAAC GCACAT---- B28 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B29 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B30 AATTTR-MAR AAYWCAGARA ATCAKMGAK- ---------- -TMTTTGAWC KCMCAY---- B32 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B33 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B34 MAT-TG-AAT AATTCARTKM ATCATMGAG- ---------- -YCTTKKAWY SCMCRT---- B35 AATATK-MAK AAWWCAKTRA ATCATMSAK- ---------- -TGYWWSAAY KCACAT---- B36 -AATTG-CAG AATTCAKRGA WTCATSRAG- ---------- -TCTTTKAAC KCWCAT---- B37 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B38 -AATTG-MAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TYTTTGAAC GCACAY---- B39 -AATWR-CAS AATTMARTGA AWYATCKART CKTTRAWYGC AAMATTGCGC CCTCCTSRTW B41 -AATTG-CAR AATTCARTGA ATCAKYGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B42 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- B43 -AATWG-CAK ARTTCMGTGA ATCATTTRA- ---------- -WCTWWSAWC GCACAT---- B44 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- D48 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- D49 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- D50 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- D51 -AATTG-WRR AATTMARTGA ATMATCSAG- ---------- -KMTTTRWRC RYMCAY---- D52 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- D53 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- D54 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- D55 ACWTTA---- CGTATCGCAT TTCGMWRCG- ---------- -TTCTTCATC GATGCCG--- D56 -AATKG-CAA AATTCAKTGA AYCATCSAG- ---------- -TSTTTGAAC SMMCAT---- E57 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- E58 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- F59 -AATTG-CAG AATTCARTGA ATCWTYKAA- ---------- -TCTTTGAAY KCACAT---- F60 -AATTR-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- F61 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- F62 TTAYTTGKAC CTTTCATYTA WGAAWWCTRG ---------- -TGACWCRWC GCATGAG--- F63 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- G64 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- G65 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCKAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- G66 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- G67 -AATTG-CAR AATTCAKTGA ATCATMGAG- ---------- -TYTTTGAAC GCMCWT---- G68 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- G69 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- G70 -AATTG-CAG AATTYAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTSAAC GCACAT---- J74 -AATTG-CAR AATTCAGTGA ATCATMGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J76 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J77 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAA- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J78 -AATTG-CAR AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J79 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J80 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J81 -MATWR-CAS AATTCAGTGW ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAMM GCACAT---- J82 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J83 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J84 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J85 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- J86 -AATTG-CAG AATTCAGTGA ATCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCACAT---- KU855474.1 -AATTG-CAG AATCCCGTGA ACCATCGAG- ---------- -TCTTTGAAC GCAAGT---- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 665 675 685 695 705 715 Ab1 ---------- --------CA CTTCGG---- -AACGGA--- ----TTTC-- CGGTCTCCCC Ab2 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGARC Ab3 ---------- --------CA CT-CGG---- -AACGGA--- ----TATCT- CGGTCTCGC- Ab4 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ----AAGAAC Ab7 ---------- ----TGCCCC CSYCGG--TA TTYSGGG--- -GGGSATRS- CTKTTYRAAM Ab8 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCSGGG--- -GGGCAYGC- CTGTCCGAGC Ab9 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATSC- CTGTCCGAGC Ab10 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC Ab11 ---------- -----GAACC AAKAGATCCG TTRTTGAAAG TTTTAACGAT TTTTTGTATC Ab12 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC Ab13 ---------- -----WAAYC AARAMAKCCG TSRWKRAAAG TTTTAMCRAT TTTTTWTATY Ab14 ---------- ----TGCGCA CTYYTGG-YA TTMCGSG--- -GGGCATSC- CYGTCMMAYC Ab16 ---------- ----TGCGCC CCMTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC Ab17 ---------- ----TGCYCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGMATSC- SKGKCCWASC Ab18 ---------- ----YSCSCC CCSWGG--TA KKSSGGG--- -GGGCATGCT CKRTCSGRGS Ab19 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC Ab20 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCRAGC Ab21 ---------- ----TGCGCC CSCWRK--TA TTCYGGK--- -GGGCATGC- CTGTGCGACC B22 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--KA TTYYGGG--- -GGGSATRC- CYGTSYSAGM B24 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B25 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B26 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B27 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B28 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B29 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B30 ---------- ----YSCSCC CCCYGG--TR TWSCGGG--- -GGGCAYGC- MYSTYYGAGM B32 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B33 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B34 ---------- ----YGYTCC CCCYSG--TA TTSCKGG--- -GGGRRKGC- CWGTSCKAGC B35 ---------- ----TKYKCC CCCTGK--KA TTCCGGGCCC SRGGSATGT- TYGKGSCATS B36 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGS- SKGTCCGAGC B37 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B38 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGASC B39 YTSSGGGGGA TGCWTGTTCC CTCTGGTTTC AACCCGG--- -GAGCCC-C- CGGKCMTGGS B41 ---------- ----TSCSCC CCYTGG--TA TTCSGGG--- -GGGCATGC- CTGTMCGAGY B42 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC B43 ---------- ----YGCSCC CTCTGG--KR KKGCGKG--- -GGGSATGC- CTGKCCRAKS B44 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC D48 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC D49 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGMATGC- CTGTCCGAGC D50 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC D51 ---------- ----YGSSCC CYYTGG--YA YTCCGGG--- -GGGWATGC- SKGKSSGAGY D52 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC D53 ---------- ----TGCSCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC D54 ---------- ----TGCSCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC D55 ---------- -----GAACC AAGAGATCCG TTGTTGAAAG TTTTAACGAT TTTTTGTWTC D56 ---------- ----TGCMMC CTYKGG--WA TTCCSGG--- -GGSCATSC- CTGKSSGARK E57 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC E58 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC F59 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TKCCGGG--- -GGGYRTGC- CTGTCCRAKC F60 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAKC F61 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC F62 ---------- TTTMTTCASC CCGCGC---A TTCGGTGAAG TTGTTGTGYW GAATCCTTCK F63 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC G64 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC G65 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTYCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC G66 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC G67 ---------- ----TGCGCC CYCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATSC- CTGTCCGAGM G68 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC G69 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC G70 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--KA TTCCGGG--- -GGGSATGC- CTGTCCRAKC J74 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J76 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J77 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J78 ---------- ----TGCSCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATKC- CTKTMYKAKC J79 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J80 ---------- ----TGCGCC CTCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J81 ---------- ----TGCGCC CCMTGG--TA TTCSGGG--- -GGSCAKKC- CTGTCCKAGC J82 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J83 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J84 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J85 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC J86 ---------- ----TGCGCC CCCTGG--TA TTCCGGG--- -GGGCATGC- CTGTCCGAGC KU855474.1 ---------- ----TGCGCC CGAAGC---C ATCCGGCCG- AGGGCACGC- CTGCCTGGGG ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 725 735 745 755 765 775 Ab1 T----TCAAT AAA--AAACC CACAAACAWK AAAAAMS--- ---------- ---------- Ab2 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT Ab3 -----TCGAT G-A--AAACG CATAASCTCG ATGAAAA--- ---------- ---------- Ab4 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 G--------- -------CAG CA-------- ---------- ---------- ---------- Ab7 G----TKATT GST--GGCCT TTTRKACTGG RTATGAWMAT TGGG--SCCC CCTMCCCCAT Ab8 G----TCATT GCT--SCCCY CAAGCACGGC TYGTGTG--T KGGS--CCCC CS-TCCCCCT Ab9 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT Ab10 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT Ab11 GGTAMTCAGM CTGCAACCTT -CAGACAGTG TTCMTGG--T TGAGGTCTCC GG-------- Ab12 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGKGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT Ab13 GRWWYTCMWA MTGSRACCTT TCAGAMAGSG KYCRTGG--G TGAGGKCTCC GG-------- Ab14 G----WMMTT RCWR--SCCK CWR-YTCGTC YTGGGKR--R TYGG--SCCM CG-TCCCCGW Ab16 G----TCATW GCT--GCCCT CAAGCACGGM TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT Ab17 G----TCATT GMT--GCCCT CAAGSACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CKTMCCCCT- Ab18 G----KCATT SCT--GCCMT CAAGSWYRKK TTGTKKG--T TGG---SCCC CCGTMCCCCW Ab19 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT Ab20 G----TCATT GCT--GCCCT CAASCACGGC TTGWGTG--T TGGG--CCCC CS-TCCCCCT Ab21 G----TTATT ACA--ACCCT CGAGCCCCCG RGGGTGGCCT TGGGGATCGT CATTGCTGCC B22 G----TCATT KYT--GCCCY CAARMRCGGS TTKTGTGT-T TGGG--CCCC CK-TCCCCCY B24 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B25 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B26 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B27 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B28 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCC B29 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC B30 G----YCWTT GYY--SCCCY CAARCACGRY TTGTGTG--T KGGG--CCCC CS-TCCCCCY B32 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCC B33 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B34 S----TCATK KCT--KCCCT CARSSMMRGS TTGYGTG--T TGGG--CCCC CS-YCCCCCT B35 G----TCATT SCT--KYCCT CAATSAMGGC TTGYSTG--T WGGG--CCCC CG-TCCCCCT B36 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCMCGSC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B37 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B38 G----TCATT GCT--GCCCT CRAGCACGGC TTGYGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B39 G----ATGSK GA----YCCT CAAGSMCSSC TTGKGKG--T TGGG--CCCC CASYCCCRRW B41 G----TCATW GCT--KCCMT CAAGCMCGGS TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT B42 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCC B43 G----TSATT GCT--GSCCT CRAKYGCGGS TTGKGTG--Y TGGG--CCCC CK-TCCCGGM B44 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT D48 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT D49 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGM TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC D50 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC D51 G----TCATT GYT--GSCCY CRARCATSGC WTGYSMGY-T YGGG--CCCC CSGTCSCGGK D52 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC D53 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTKTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT D54 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTKTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCCCT D55 GGYACTCAGA CTGCAACCTT -CAGACAGKG TTCATGG--T TGAGGTCTCC GG-------- D56 G----TCATT GCT--MCCCT CAAKCCCGGY TTGKGTG--T KGGG--TCCC CYGTCCCGGC E57 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC E58 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC F59 G----TCATT GCT--GMCCT CRASCACGKC TKSKGTG--Y TGGG--CCCC CG-TCCCGGM F60 G----TCATT GCT--SCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGS--CTTC CG-TCCCTGG F61 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CCGTCCCGGT F62 GG-GSTCRTG GCTTTGTCTT CGAGTGAGAG TTTCCRAGGT TGCTYKTTGC AATGRMTCGG F63 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC G64 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCCGGC G65 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC TTGTGTG--T TGGG--CCCC CG-TCCYCCT G66 G----TCATT GCT--GCCCT CAAGCACGGC 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GCGGCG-GCA CC--GTGTCC B28 -----CCAAG ----GGG-AM GGG-----CC CGAAAGG-MA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC B29 GAAGCATCAG CCCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC B30 -----CCCAC RGARGGGGAC RGG-----CC CR-AAARRCA GCGGRG-RCA CC--GKSTCC B32 -----CCAAG ----GGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC B33 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC B34 -----CCCAG KAMSGGG-AS GGG-----CC CGAAAAGCCA RCGGCS-GSR CC--SYGWCC B35 -----CCCAG GAARGGS-MC GGK-----MC CGAAAGGCRG CCCTCS-ARM SC--AWGKSC B36 -----YCCAS GAAGGGG-AC GGG-----SM CGAAAMS-CA RMGGCR-GCR CC--GYSYCC B37 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC B38 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----SC SGAAAGG-CA GCGGCG-GGA CCGSGTGTCC B39 ----TCTYTA AGCCGGG-AC GGGCCGTCCC CSAAAKG-CA KTGGCG-GTA CC--TAATCC B41 -----CCCAG GAAGGGG-RC GGG-----CC MGAAAGG-CA GCGGCG-GCR CC--GTGTCC B42 -----CCAAG ----GGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC B43 RARRCAYCRG CCCCGRG-AC RGG-----CC CGAAAGG-SA GSGCSG-GKC MC--GGSTCC B44 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC D48 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC D49 GAAGCATCAG CCCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GSA CC--GTGTCC D50 GAAGCATCAG CCCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC D51 ----TCTYCM M-CCRGG-RC GGR-----CC CGAAARR-MM GMSMSG-RMA MY--SYSYCC D52 GAAGCATCAG CCCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC D53 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCR CC--GTGTCC D54 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCR CC--GTGTCC D55 -------CGG GCACGGGCCC GGGGG---CA GGGAARCCCC CCGGCGGCCA CG-AAGGGCG D56 ----YCTCCA C-SCGGR-RS GGGM----CC ARAAAGR-SA GCSGYR-GMR CC--GTGTCC E57 GAAGCATCAG CCCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC E58 GAAGCATCAG CCCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC F59 GAAGCATCAG CCCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CM SCGGCG-SSA CC--GTGTYC F60 ---------T ARCGGGG-AC GGG-----YC CAAAAGG-MA GKGKCG-GCM YC--ATGTCY F61 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GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC J80 ----TCTCCA AGCCGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC J81 -----CCCAG GAAGGGG-MC GGR-----MM SGAAAGG-CA GSGGCG-GCR YC--GTGTCC J82 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC J83 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC J84 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC J85 -----CCCAG GAAGGGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC J86 -----CCAAG ----GGG-AC GGG-----CC CGAAAGG-CA GCGGCG-GCA CC--GTGTCC KU855474.1 --------GG GACTGCGAGC GGCG-----G ATGATGGCCT CCCGTGGGCC TCG-ACTCGC ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 845 855 865 875 885 895 Ab1 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab2 GGTCCT-CRA GCGTATGGGA AGCAAC---- ---------- ---------- ---------- Ab3 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab4 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab7 GTACCC--GA ACSKTWTGSA RRCCWAKW-- ---------- ---------- ---------- Ab8 GGTCMT-CGA RCGTAWGGGA AGCACWYTTT -TGTCTSCCM CTCKARCGTA GGTSCGGMMG Ab9 GGYCCT-CGA GCGKATGGGA AGCMGGCACC GTGTCCGGTC CTCGAGCGTA TG---GGAAG Ab10 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTTTT -TTGTCACCC GCTCCTGTAG GTCCGGCCGG Ab11 GGCCCGCCGA -AGCAACAGG G--------- ---------- ---------- ---------- Ab12 G---CA-C-- -CGAAAGG-Y AGCGGC---- ---GGCACCG TGTCC----G GTCCT-CGAG Ab13 GCCCCMCSGA GAGCAMCRGG G--------- ---------- ---------- ---------- Ab14 KKTCCCAAGM S--------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab16 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA ARCA------ ---------- ---------- ---------- Ab17 GGTCCT-CWA AGGTATGGGA ASCAACT--- ---------- ---------- ---------- Ab18 YGKWAA--GK STKKGCG--- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab19 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTTTT -TGTCACCCG CTCCT--GTA GGTCCGGCCG Ab20 GGTCCT-CRA GMGTATGGGA ASCAACT--- ---------- ---------- ---------- Ab21 KGKCGS--MR AAARSCTW-- ---------- ---------- ---------- ---------- B22 GGCTCCTMGA GCRTATGGGA ARCAACTT-- ---------- ---------- ---------- B24 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- B25 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCA------ ---------- ---------- ---------- B26 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCA------ ---------- ---------- ---------- B27 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCA------ ---------- ---------- ---------- B28 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTTT- ---------- ---------- ---------- B29 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- B30 R-STCYYCGA RYGTATRGGA ARMAACWT-- ---------- ---------- ---------- B32 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAAC---- ---------- ---------- ---------- B33 GGTCCTCCGA GCGTATGGGA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- B34 G-KWYSKSGA YCKKAWGGGA ASYMACYT-- ---------- ---------- ---------- B35 G-GTCCTCRA SYGTAKGGKA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- B36 GGTCCTCSRA CCTTAWGGGA ARCAAMT--- ---------- ---------- ---------- B37 C-CCCT-CCC AGGAAGGGGA CGGGCC---- ---------- ---------- ---------- B38 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACT--- ---------- ---------- ---------- B39 SGYCMT-CYT SSRWATGGKR G--------- ---------- ---------- ---------- B41 GGTCYT-CGA GCGTATGGGA AGCAACT--- ---------- ---------- ---------- B42 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTTT- ---------- ---------- ---------- B43 GRTCCT-MRA GWGYATGGGK K--------- ---------- ---------- ---------- B44 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- D48 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- D49 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG S--------- ---------- ---------- ---------- D50 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- D51 GGSCCS-MSA GYGKRKGGGG S--------- ---------- ---------- ---------- D52 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- D53 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAAC---- ---------- ---------- ---------- D54 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAAC---- ---------- ---------- ---------- D55 GGCCCGCCGA -ASCAACAGG G--------- ---------- ---------- ---------- D56 GMWCCT-MGA GYRKATGGGG M--------- ---------- ---------- ---------- E57 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- E58 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- F59 SGTYCT-CGA GSGTATGGKG Y--------- ---------- ---------- ---------- F60 GGTCCT-CGA SCGTATGGGG Y--------- ---------- ---------- ---------- F61 GGTCCT-CGA GTGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- F62 GRTSTCWTTG YCATTSYTAM GCCGGCAYG- ---------- ---------- ---------- F63 GGTCC---GA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- G64 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- G65 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCWWC---- ---------- ---------- ---------- G66 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAAC---- ---------- ---------- ---------- G67 GSYCCT-MGA GKGTATGGGG Y--------- ---------- ---------- ---------- G68 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- G69 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- G70 GGTCCT-CRA GSGTATGGGK C--------- ---------- ---------- ---------- J74 GGTCCT-MGA GTGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- J76 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- J77 GGTCCT-CGA GCGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- J78 GGTCMT-CGA RWGTATGGKA ASCAAC---- ---------- ---------- ---------- J79 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA ARCA------ ---------- ---------- ---------- J80 GGTCCT-CGA GTGTATGGGG C--------- ---------- ---------- ---------- J81 GGTCCT-CGA GCGTAWGGGA AGCAACT--- ---------- ---------- ---------- J82 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- J83 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAAMTT-- ---------- ---------- ---------- J84 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTT-- ---------- ---------- ---------- J85 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAAC---- ---------- ---------- ---------- J86 GGTCCT-CGA GCGTATGGGA AGCAACTTT- ---------- ---------- ---------- KU855474.1 GGTTGGTCTA AATTTGGGTC CTCGG----- ---------- ---------- ---------- ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 905 915 925 935 945 955 Ab1 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab2 -----TTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT Ab3 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab4 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab7 -------KTW WWCWCCCTG- C----TCTWG AGARG----- --YCCGGCCG GMG---KSST Ab8 CAACTTTTTC -WCMCCCYC- -----TCCTG TAGG------ --KSCGGGCG GSG---GTCT Ab9 CAAYTTTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT Ab10 CGGCCTGCCC AACCCCAACC T----TCTTT TTCT------ --AACCGCCG GSG---GMCT Ab11 -----TACAA ATAG-ACMMG -----GATGG GAGG------ ---ACGGACA CCCCGCGAAG Ab12 CGTACTTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --KSCGGCCG GCG---GCCT Ab13 -----MACMA ATAGRRYWCR -----GATRG GAGG------ ---ACGCCCA CCCCCCCAAG Ab14 ---------- -KMACCTSC- ---------- ---------- --AAWGGTAG WAG------- Ab16 --ACTTTTTG -TCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT Ab17 ------TTTT GTCAGTSSC- -----KCCR- WAGG------ --TAYGGCSR RCG---RMCT Ab18 ---------- ---ACCCAT- A----TC--- ---------- -------CGG TGC---AACT Ab19 GMGGCCTTTG -TCACCCGM- -----TCCYS WARG------ --KCCGGSCG GMG---GSCT Ab20 ------TTTT GTCACCSGS- -----TCMTG TWGG------ --KCCRGCCG GMK---GSCT Ab21 ---------- --YCGCCAA- A----TC--- ---------- -------CGW G-----TCCG B22 ------TTTK -TCACCTCC- -----TTCCG GAAG------ -KYCSGGCGG GGG---SCTT B24 ------TTTG -TCACCCGC- -----TCCCG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT B25 --ACTTTTT- GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GSG---GSCT B26 --ACTTTTTG -TCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --KCCGGSCG GSG---GCCT B27 --ACTTTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT B28 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT B29 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA B30 ------TTYR -TCACCCGC- -----TCYYG TAGGTCCMCC YTWTTGGCCG SCG---GCCY B32 ---TTTTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT B33 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT B34 ------TTKT SYCACCRSY- -----TCSYG KAGS------ -TCTYGSCCG RMR---GCMT B35 ------TKTT GYCWSCCSC- -----TCCTG WASS------ -TWSS-TYYK RCS---RCCT B36 ------TTTT GTCMCCCGCT -----CTYTG TAGG------ --TCCGGCCG GCGC--GCMT B37 -----CGAAA GGCAGCGGCG G----CACCG TGTC------ --TCCGGCCG GCG---GCCT B38 ------TTTT GTCMCCCSS- -----TCCWG WAGG------ --TCCGGCCG SCG---GCCT B39 ------TMKG -TCACCCMY- -----TSMAG YACGR----- --ACKWSCGA AGG----KCG B41 ------TTTT GTCACCCSC- -----TCCTG KAGG------ --KCCGGSCG GMG---KCCT B42 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT B43 ------TCTG -TCACCCRC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCM B44 ------TTT- GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT D48 ------TTT- GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT D49 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAKG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA D50 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA D51 ------TSKG -TCACCCAY- -----TSGYG WAGAR----- --TCGGTCCS YCG---GCCR D52 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA D53 -----TTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGMCG GCG---GCCT D54 -----TTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGMCG GCG---GCCT D55 -----WACAA ATAG-ACACG -----GATGG GAGG------ ---ACGGACA CCCCGAGAAG D56 ------TCTG -TCACCMAC- -----TCGCG TAKG------ --SCMGKCCG GCG---GCCA E57 ------TCTG TACACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA E58 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA F59 ------TCTG -YCMCCCGC- -----TCGWG TAGG------ ---------- ---------- F60 ------TTTG -TCACCCGC- -----TCCCG TAGG------ --TCCAGCTG GCA---GSTA F61 ------TCCG -TCACCCAC- -----TCGTG TAGG------ --CCCGGCCG GCG---GCCA F62 AWKTYSRCTY ATCGACCGWA CGRTSTCWTT GYCATTS--- -YTGKGGTRG ARGKMYKGYM F63 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA G64 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA G65 --TTTTKCGT RTSRSMMGC- -----TYCTK TWKG------ --TCCGRCCS GCG---GCCT G66 ----TTTTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGYCG GYG---GMCT G67 ------TCTG -TCWCCCAC- -----TCGSG TAGR------ --SCCGGCCG GCGS--GCCA G68 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA G69 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT G70 ------TCTG -TCACCCSC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA J74 ------TCTG -TCACCCAC- -----TCGTG TAGR------ --CCCGGCCG GCG---GCCA J76 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA J77 ------TCTG -TCACCCGC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA J78 -----WTTTY GTCYYCYGC- -----TCYWG KAGG------ --YCCGGSCG GMG---KYCT J79 --ACTTTTTG -TCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT J80 ------TCTG -TCACTCAC- -----TCGTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCA J81 ------TTTT GGCACCCGC- -----TCCAG GAGG------ --GCCGGGCG GCG---GGCT J82 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT J83 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT J84 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT J85 ---TTTT--T GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT J86 ------TTTT GTCACCCGC- -----TCCTG TAGG------ --TCCGGCCG GCG---GCCT KU855474.1 ------TCAC GGCAGCCGT- -----GGCAA CAGG------ ----TGGTCG TCGA--TGAT ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 965 975 985 995 1005 1015 Ab1 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab2 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTTTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG Ab3 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab4 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab7 WYC----CMM CCCCAMTTTT TTTTTAA--- -----AAGGT GGGCCTCGAA CCAGGGAGGG Ab8 GCC----CAA CCCCAA---T CTTTTTT--- -TAACCMRGG TGACCTCCGA TCAGGGAGGG Ab9 GCC----CAA CCCCAACYTT YTTTTTC--- -TAACCAGGW TGACCTCKGA TCARGGARGG Ab10 GCC----CAA CCCCAACCTT YTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGKAGGG Ab11 GGGCATCCAA ACACTCGGYA ATGATCCT-- ----TCCGCA GGTTCACCTA CGGAAA---- Ab12 GSC----CAA CCCCRACCT- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab13 GTGGATCCTG ACCCTCCCGC ATGATCTG-- ----GGAGGA CGCCCACCCC SCCAARGTGS Ab14 ---------- ---------- ---------- -------GTS AYMCCTCGCT GAATATGAGS Ab16 GCC----CAA CCCCTAACCT TTTTTTT--- --AACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG Ab17 KCC------- ---------- ---------- ----CWWTSY CAMCCGC--- ---------- Ab18 TWW----WWR CACCCMTMKC YGKWAAG--- -----KSTKK GCGACCCATA TCCGGTAG-- Ab19 GYC----CAA CCCCAA---M CTTTTTT--- -TAACCARGT TGACCTCGGA TCAGGKAGGG Ab20 GCC----CAA CCCMCAAACS TTTTTTA--- ---ACCAAGT TGACCTCGGA TCAAGTAGGG Ab21 GWC----CKC SACGCGTAKG GRAASCM--- -----KTMST RGKMAMCCCY TCCG-TAG-- B22 GCCCA----M CCCYACCTTT TTTTTTW--- -AACCMRGGT CGCCCTGATA TCGGGGGGGG B24 GCC---CAAC CCCCATCAAT CTTTTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B25 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTTTT---- -TAACCAGGG TGACCTCGGA TCAGGGAGGG B26 GCC----CAA CCCCAA---C CWTTTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGGAGGG B27 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B28 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTACTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B29 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B30 SCCCA----M CCC---CMTT TT-------- -AACCGGGGT -GATCTCGGA ACGGGTGGAG B32 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTACTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B33 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B34 GYYCMT---Y MCCCAACSTT STTTTTY--- -TAACCAGGA TGGATTCCCA TCAAGTTTAA B35 GCCCM----Y CCCCAWCMTT CTTTTTC--- -CCCCCTG-A TGACCTCCCA TCATGTATGG B36 SCC----CAM SCCCACACCT TWTTTTA--- ---ACCAGGT TGACCTCGGA TCAAGTAGGG B37 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B38 GTC----CYA CCCCAACCTT TTTTT----- --AACCAGGG TGACCTCASA TCAGGTAGGG B39 RCCWC-TTCT ACYGWAATAW YACCACA--- -STG------ AATTCTCGGA TAAGGTAGGG B41 GCC----CAA CCAMCAACCT TTTWTTA--- ---ACCAGGC GGACCTCCGA TCAAGTAGGG B42 GCC----CAA CCCCAACCTT TTACTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG B43 RCC----CGA CCCTTWMATT TTTCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA GCAGGTAGGG B44 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTTT----- --AACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG D48 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTTT----- --AACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG D49 GCC----CRA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG D50 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG D51 RCCTC-TTCT CCCGAAGGGT TCCTTTT--- -AAAAG--GT TCACCAATGA TTACGGAGGG D52 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG D53 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTTTTT--- -TAACCAGGT TGRCCTCGGA TCAGGGAGGG D54 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTTTTT--- -TAACCAGGT TGRCCTCGGA TCAGGGAGGG D55 GGGCATCCAA ACACTCGGTA ATGATCCT-- ----TCCGCA GGTTCACCTA C--------- D56 GSCTC-TTCC AMCCAAAACK TCCTTTT--- -TAACCCCGT TTTCCTCGGA GGGCGTCCGG E57 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG E58 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG F59 ---------- CCCCK----- ---------- ----CCGAGT AGGCKCYGYC GWCGGCCAG- F60 GCC------- -TCGCCACCA ATCTCTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAAGTASGG F61 GCCTC-TTTC AACCAAAAC- -TTCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG F62 KCCKTSMGAA YSCCGSCSAK CAAYGGYG-- ---ATACGAA AGAATTCTAA CTTGGAAATT F63 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG G64 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG G65 GCC----CAA CCCC------ ---------- ---------- ---------- ---------- G66 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG G67 GCCTC-TT-C AACCAAAACT TTTTTT---- ---------- TCTCTTC--- ---------- G68 SCC----CGA CCCTYYMACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG G69 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG G70 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAAGTAAGG J74 GCCTC-YT-C AACCAAAACG TTTTTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J76 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J77 GCC----CGA CCCTTTAACC AATCTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J78 GCC----CAA CCCCAATCTT TTTTTCA--- ----CCAAGT TGACCTGATA TCCCGGAGGG J79 SCC----CAA CCCCAACCTT TTTTTTTTTT TAAACCAGGT TGACCYCGAA TCAGGKAGGG J80 GCCTC-TT-C AACCA----- --TTTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J81 GGC----CAA CC-CCAACCT TTTTTTA--- ---ACCAAGC TGACCTCACC TCAGGTAAGG J82 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J83 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J84 GCC----CAA CCCCAACCTT CTTTTTC--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J85 GCC----CAA CCCCAACCTT TT---TT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG J86 GCC----CAA CCCCAACCTT TTTACTT--- -TAACCAGGT TGACCTCGGA TCAGGTAGGG KU855474.1 TCG-----GT GCCCTGCCAC GTGCTCCG-- --GACAAAAG CGTCGAGAGA CCCCACAAAC ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| 1025 1035 1045 1055 1065 1075 Ab1 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab2 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTACCT ---------- ------CG-- GATCAGGKAR Ab3 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab4 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab7 AT------CC CCC--CTAA- --TTTTAAT- ---------- ---------- ---CCCTAAT Ab8 AT------WC CCC--CTT-- --AATTTA-- ---------- -----AAM-- -----ATAAR Ab9 AT------AC CCM--CTT-- --AATTTA-- ---------- -----AAA-- -----ATAAA Ab10 AT------WC CCS--CTKA- --AKTTWAAG ---------- ---------- -------ATT Ab11 ------CCTT GTTGYAATGA TCCTTCCGCA G--------- ---------G TWCACCTACG Ab12 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab13 RTCCTGACCC TCCCKCAKGA TCATTCAGCR R--------- ---------G AYCWYCTAAG Ab14 GG-------T CCGY------ ---------- ---------- ---------- ---------- Ab16 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAGC ATACAKGTA- ----GGGATA CCCGCTGAAT Ab17 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ab18 -T------CT AGK--CGTA- --AAACTTG- ---------- ---------- ---CCMAAC- Ab19 AT------AC CCG--CTKR- --AGTTTT-- ---------- -----AAG-- -----ATTGS Ab20 GA------CC CGG--TTGA- --GTTTAAGA G--------- -----GGGAC CCGGTTGAGT Ab21 -S------SW YWG--CYKG- --YGGCCCA- ---------- ---------- ---CCCAAC- B22 AT------CC CCT--TTAA- --GTTTAGA- ---------- ---------G ATT---AAGA B24 AT------AC CCG--CTG-- --AATCAGG- ---------- --TAGGGATA CCCGCTGAAK B25 AT------AC CCG--CTGA- --ATWTAA-- ---------- -----AAGAA WCCGCTGAAT B26 AT------AC CCG--CTTG- --ATTTAA-- ---------- -----AAG-- -----TATAT B27 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAA-- ---------- -----AAG-- CCCGCTGAAK B28 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAA-- ---------- -------AGA TT--TAAAGA B29 AT------AC CCG--CTG-- --AATCTCGG ATCA------ GGTAGGGATA CCCGCTGAWT B30 AT------CC CCT--CTGA- --ATATAAA- ---------- ---------C ATAGGTAAAC B32 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAG- ---------- ---------- CATAAT---- B33 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAGC ---------- ------ATAA G---CTGAAT B34 AT------AT AAG--GTTA- --ATTTAAG- ---------- ---------A ATAASTWAAT B35 AT------AC CCA--CTGA- --ATTTAAA- ---------- ---------C ATAAAAAARC B36 AT------AC CCG--CTTA- --ATTTAAAC ---------- --------AA CCCKCTKAAT B37 AT------AC CCG--CTGA- --RTTTAAG- ---------- -------CAT AAAACTGART B38 AT------AC CCA--ATAA- --ATTTAAG- ---------- ---------- ----CATAAT B39 AT------AC CCG--CTG-- --AATT---- ---------- ---------- TAAGCATAAT B41 AT------AA CCG--CTCA- --ATTTAAG- ---------- ---------- -----CATAT B42 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTTT-- ---------- -------ACC CG--CTGAAT B43 AT------AC CCG--CTG-- --AATTAAA- ---------- ---------A ACR--MTRAW B44 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAGC ---------- ------ATCC G---CTGAAT D48 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTACCC ---------- ------G--- ----CTGAAT D49 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAAG ---------- ---------- -----TGAAT D50 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAA- ---------- ------GATA CCCGCTGAAT D51 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAA- ---------- -------GAA TCCGCTGAAT D52 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTGG- ---------- -------ATA CCCGCTGAAT D53 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAG- ---------- ---------- CCCGYTSAAT D54 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAG- ---------- ---------- CCCGYTSAAT D55 ---------- ---------- -CGATCCKCA G--------- ---------G TTCACCTACS D56 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTA-- ---------- --------AC CCCGCTGAAT E57 AT------AC CCG--CTG-- --AATTT--- ---------- ---------- CCCGCTGAAT E58 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAA- ATCA------ GGTAGGGATA CCCGCTGAAT F59 ---------C CCG------- ---------- ---------- ---------- -----ACCCT F60 AT------AC CCG--CTG-- --AATTASG- ---------- ------GATA CCCKCTRAAT F61 AT------AC CGG--ATC-- --AGGTAGG- ---------- ------GATA CCCGCTGAAT F62 TTCCGATTAC CCG--CTG-- --AATTTAT- ---------- ---------A CCCGCTGAAT F63 AT------AC CCG--CTG-- ---AGGTAG- ---------- -----GGATA CCCGCTGAAT G64 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAA- ---------- GGTAGGGATA CCCGYTGART G65 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- G66 AT------AC CCG--CTAT- --CAGGTAGG ---------- ------GATA CCCGCTGAAT G67 --------AA CC-------- ---------- ---------- --------AA AACWTTTTTT G68 AT------AC CCGACCTCGG ATCAGGWAG- ---------- -----GGATA CCCGYTRAAT G69 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAGC ---------- ------ATAA G---CTGAAT G70 AT------AC CTG--CTG-- --AATTTAA- ---------- ---------G CCTGCTGAAW J74 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAAC CA-------- ------GATA CCCGCTGART J76 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAA- ---------- ------GCAT AACGCTGAAT J77 AT------AC CCG--CTG-- --AATGTAG- ---------- -----GGATA CCCGCTGAAT J78 AT------AC CCC--CTAA- --ATTTAAGG ---------- ------GATA CCCSCTAAAT J79 AT------AC CCG--CWAA- --ATTAAA-- ---------- -----ARAWA CCCSYWAAAT J80 AT------AC CCG--CTG-- --AATTTAAG CATAAGATCA GGTAGGGATA CCCGCTGART J81 AT------AC CCG--ACCA- --ATTTAATT ---------- -------AAA AAATAACAAT J82 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAGG ---------- ------GATA CCCGCTGAAT J83 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAGC ---------- ------ATAA CCCGCTGAAT J84 AT------AC CCG--CTGA- --RTTTAAGC ---------- ------ATAA CG--CTGART J85 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAG- ---------- ---------- CATAATGAAT J86 AT------AC CCG--CTGA- --ATTTAAGC ---------- ------ATAA CG--CTGAAT KU855474.1 TTGA----CC CCGATGCACC CCACTTCGG- ---------- -----TGCTT CCAACGCGAC ....|....| ....|....| ....|....| ....|....| .... 1085 1095 1105 1115 Ab1 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab2 GGAARSAWTA A--------- ---------- ---------- ---- Ab3 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab4 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab6 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab7 TTWAWYAAAA AA-------- ---------- ---------- ---- Ab8 A--------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab10 TKAA------ ---------- ---------- ---------- ---- Ab11 GAAACCTTGT T--------- ---------- ---------- ---- Ab12 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab13 GAAACCTTGT T--------- ---------- ---------- ---- Ab14 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab16 TTAAGCATAA TS-------- ---------- ---------- ---- Ab17 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- Ab18 -----CCCAG AC-------- ---------- ---------- ---- Ab19 AAAA------ ---------- ---------- ---------- ---- Ab20 TTAAGATTAA GSATGK---- ---------- ---------- ---- Ab21 -----CAACA AC-------- ---------- ---------- ---- B22 TTAA------ ---------- ---------- ---------- ---- B24 TTAARSMWK- ---------- ---------- ---------- ---- B25 WTAAAASAAT GAGAA----- ---------- ---------- ---- B26 RTAAAAGTAT AAAAAWAA-- ---------- ---------- ---- B27 TTAAAAGAAT KAA------- ---------- ---------- ---- B28 TTAAAA---- ---------- ---------- ---------- ---- B29 TTARGMATKA ---------- ---------- ---------- ---- B30 ATAGG----- ---------- ---------- ---------- ---- B32 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- B33 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- B34 TTAARMRTAA ---------- ---------- ---------- ---- B35 ATAAAA---- ---------- ---------- ---------- ---- B36 TTAAWCATAA AAA------- ---------- ---------- ---- B37 TTAAGCATAA AA-------- ---------- ---------- ---- B38 TTAARYATAA ---------- ---------- ---------- ---- B39 T-AAGYATAA ---------- ---------- ---------- ---- B41 TWAAKYATAA ATAA------ ---------- ---------- ---- B42 TTTAAGCWTA A--------- ---------- ---------- ---- B43 TTAAAAAAAA A--------- ---------- ---------- ---- B44 TTAAGCATAA A--------- ---------- ---------- ---- D48 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- D49 TWAARMATAA ---------- ---------- ---------- ---- D50 TTAAKMATAA ---------- ---------- ---------- ---- D51 TTAAGMATAA A--------- ---------- ---------- ---- D52 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- D53 TTAARCATAA ---------- ---------- ---------- ---- D54 TTAARCATAA ---------- ---------- ---------- ---- D55 GAAACCTTGT ---------- ---------- ---------- ---- D56 TTAACCRTKA AWWT------ ---------- ---------- ---- E57 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- E58 TTAAGMATAA ---------- ---------- ---------- ---- F59 TTAACC---- ---------- ---------- ---------- ---- F60 TTAAKCAWAA TAGAATAAGT TGGTATCTCT TGCTTCGGAG TTCT F61 TTAAGYTWAA ---------- ---------- ---------- ---- F62 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- F63 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- G64 TTAAGMATAA ---------- ---------- ---------- ---- G65 ---------- ---------- ---------- ---------- ---- G66 TTAAGCATAA T--------- ---------- ---------- ---- G67 TTAACCRG-- ---------- ---------- ---------- ---- G68 TWAAGCATA- ---------- ---------- ---------- ---- G69 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- G70 TTAAKCATAA ---------- ---------- ---------- ---- J74 TTAASCATAA AAATTAGGSA AA-------- ---------- ---- J76 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- J77 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- J78 TTAARCATAA ---------- ---------- ---------- ---- J79 WWAAAMAWAA A--------- ---------- ---------- ---- J80 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- J81 TTAAKYAAAA MATAAC---- ---------- ---------- ---- J82 TTAAGCAWAA ---------- ---------- ---------- ---- J83 TTAAGCAWAA ---------- ---------- ---------- ---- J84 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- J85 TTAAGCATAA ---------- ---------- ---------- ---- J86 TTAAGCAWAA ---------- ---------- ---------- ---- KU855474.1 CCCAGTCAGG GCG------- ---------- ---------- ----