# Figure 3-5 / Table 1 排版修复报告

## 根本原因(已确认)

原稿正文中全部5个Figure嵌入标记(`{{artifact:art_XXXXXXXX}}`)使用的都是**artifact_id**
(容器级别ID),而不是`latest_version_id`(具体版本文件ID)。Claude Science的渲染器要求
`{{artifact:VERSION_ID}}`标记中的ID必须是version_id才能正确解析为可访问的图片文件——
用artifact_id会导致`host_call 'list_artifacts' failed: artifacts: version 'XXX' not found`,
图片在导出的docx/最终渲染中完全无法显示(空白或错误占位符),这正是review反馈的
"Figure 3-5排版错乱"问题的技术根源。

## 逐项核实结果

| Figure | 原稿使用的ID(错误,artifact_id) | 对应文件 | 正确的version_id |
|---|---|---|---|
| Figure 1 | art_001501fd-0b2f-4530-9a1f-2ac6795124bc | figure_arg350_mechanism_by_family.png | 8626b317-3329-4e65-9cc6-77c4a9a36cc7 |
| Figure 2 | art_b0c1ec3e-9226-4cb9-8554-5ccc962304e2 | figure_mechanism_diversity_within_family.png | c3c2ae29-819d-4fff-9af8-1c43128b38cf |
| Figure 3 | art_5654846a-5143-4c89-b187-6d57dd82c50d | figure_entropy_bestref_vs_orthogroup.png | 10ef5744-fa9a-429b-9cf7-ba9995e54fa0 |
| Figure 4 | art_6597d631-944e-40f5-ae7e-6fda581b81cd | corhmm_model_comparison.png | 8fc82d14-e1f9-4831-b910-d024383c163f |
| Figure 5 | art_666a5d16-9312-47bb-8196-c36039527d16 | jackknife_robustness.png | 4c4babcf-4555-45c8-ba46-d3dd7ff34c39 |

**修复方法**:全文档统一替换`{{artifact:art_<artifact_id>}}`格式为`{{artifact:<latest_version_id>}}`
格式(去掉`art_`前缀,替换为上表右列的version_id)。所有5张图均已确认为真实存在的PNG文件,
内容与各自caption描述一致(逐一用read_file交叉验证过图片内容)。

## Table 1 格式问题

原Table 1(Results §4)本身markdown表格语法完整、可渲染,但存在以下需要在revision中一并
修正的内容问题(不是纯格式问题,已在`table1_revised.md`中一并处理):
1. 缺少分辨率、实验方法(X-ray/cryo-EM)、构建体工程属性等关键限定信息列;
2. "5.28 Å"/"5.92 Å"等原用侧链质心距离,未标注测量口径(质心 vs 重原子),读者易误认为
   是精确的成键距离;
3. CCR5行缺少"侧链未完全解析"的标注,直接呈现质心距离容易误导。

以上已在`table1_revised.md`中重新构建为含分辨率、方法、工程突变数、精确重原子距离及其
测量局限说明的完整表格,建议投稿版本采用该新表替换原Table 1。

## 建议的下一步
在最终manuscript合并版本中,逐一执行上表的ID替换,并用docx导出后实际打开检查确认全部
5张图正常显示,再提交。